外媒 | Amazon Omics新功能升级，支持直接上传和自动化能力-普瑞纯证
亚马逊在AWS生命科学高管研讨会上宣布了Amazon Omics的新功能升级，支持35个Ready2Run工作流，包括Sentieon、NVIDIA和Element Biosciences等。这些工作流可以直接使用，无需进行任何修改，也可以使用开源管道，包括GATK最佳实践、nf-core scRNAseq AlphaFold和ESMFold等。此外，新的多部分直接上传API允许客户将数据直接上传到Omics存储，并在几分钟内将输出写入序列存储。这些工作流还可以转换为私有工作流，以支持更大的文件大小。更新的传输管理器实用程序还支持使用单个Python命令直接上传这些大文件。
除了直接数据摄取外，其他更新还包括以下功能：
- 使用NVIDIA T4和a10 GPU在Omics工作流中支持计算密集型管道和更轻松的变异查询和分析。
- 自动解析包含变异效应预测器注释的变异数据到单独的数据结构中。
- 利用与Amazon EventBridge的集成，将发布的事件作为事件驱动架构的一部分。
AWS在其博客中表示，Amazon Omics利用人工智能、机器学习和其他AWS和合作伙伴的产品和服务来运行IT密集型的生物信息学工作流程，从而消除了需要专门的基础设施和工作流程的需求。结合多种临床模式是费城儿童医院提供护理的关键，该医院的研究信息主管Jeff Pennington表示：“通过Amazon Omics，我们可以扩展对患者健康的理解，甚至可以了解他们的DNA。”
“AWS的Ready2Run工作流程的易用性、可扩展性和成本透明性，显著降低了任何规模的生物信息学家的门槛，”哥伦比亚大学医学中心基因组医学与精准基因组实验室的生物信息学主任Daniel S.T. Hughes博士在一份声明中表示。
总之，Amazon Omics的新功能升级将进一步提高生物信息学的自动化能力，支持更快速、更高效的数据上传和处理，为医疗器械行业提供更好的服务。
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